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正常人類(lèi)細(xì)胞類(lèi)型的DNA甲基化圖譜 ,德國(guó)MB助力科研

更新時(shí)間:2023-02-22  |  點(diǎn)擊率:786

DNA甲基化是一種基本的表觀遺傳標(biāo)記,支配基因表達(dá)和染色質(zhì)組織,從而為細(xì)胞身份和發(fā)育過(guò)程提供了一個(gè)窗口。目前的數(shù)據(jù)集通常只包括甲基化位點(diǎn)的一小部分,并且通常基于在培養(yǎng)中發(fā)生了巨大變化的細(xì)胞系或包含不確定的細(xì)胞混合物的組織。

近日,研究人員描述了一個(gè)基于深度全基因組亞硫酸氫鹽測(cè)序的人類(lèi)甲基組圖譜,允許對(duì)從205個(gè)健康組織樣本中分類(lèi)的39種細(xì)胞類(lèi)型的數(shù)千個(gè)標(biāo)記進(jìn)行片段級(jí)分析。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《Nature》上,文章標(biāo)題為:“A DNA methylation atlas of normal human cell types"。

相同細(xì)胞類(lèi)型的復(fù)制具有99.5%以上的同一性。圖譜的無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)概括了組織個(gè)體發(fā)生的關(guān)鍵要素,并確定了自胚胎發(fā)育以來(lái)保留的甲基化模式。在單個(gè)細(xì)胞類(lèi)型中未甲基化的位點(diǎn)通常位于轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子中,并包含組織特異性轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的DNA結(jié)合位點(diǎn)。高甲基化位點(diǎn)是罕見(jiàn)的,并且在CpG島、Polycomb靶點(diǎn)和CTCF結(jié)合位點(diǎn)上富集,這表明在形成細(xì)胞類(lèi)型特異性染色質(zhì)環(huán)方面具有新的作用。該圖譜為基因調(diào)控和疾病相關(guān)遺傳變異的研究提供了必要的資源,并為液體活檢提供了大量潛在的組織特異性生物標(biāo)志物。

DNA實(shí)驗(yàn)室,對(duì)于環(huán)境的潔凈度要求比較高,稍不注意,DNA酶、RNA酶以及雜質(zhì)DNA就會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。定期祛除這類(lèi)污染,對(duì)于DNA實(shí)驗(yàn)而言至關(guān)重要。MB大面積DNA污染 清除劑,用于日常的實(shí)驗(yàn)室清潔,祛除大面積如地板上的DNA。它采用的是無(wú)致癌性的DNA破壞化學(xué)原理。該溶液包含一種表面活性劑和一種DNA/RNA破壞劑,非堿類(lèi),非致癌類(lèi)因子。使用后,DNA和RNA在數(shù)秒內(nèi)去除。


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